Le combat contre le Roi serpent Orochi s'est déroulé il y a de nombreuses années. Une nouvelle menace point à l'horizon. Un terrible monstre semblable à un serpent à huit têtes s'est abattu sur le pays et vient à bout même des guerriers les plus puissants. Aidés de la mystérieuse Kaguya, nos héros doivent remonter le temps pour sauver leurs camarades morts, nouer de nouvelles alliances et mettre sur pied une armée digne de venir à bout de cet ennemi effroyable.